员工工资被扣，首先要确认用人单位扣薪是否合法。以下分情况为您解析：

1. 若无法律依据或合同约定，用人单位扣薪违法，您有权要求返还被克扣工资。
2. 法定义务代扣（如个税、社保等）：依据《工资支付暂行规定》第十五条，此类扣薪合法。
3. 因员工造成经济损失扣薪：需同时满足两点——确有损失，且扣后工资不低于最低工资，月扣除额不超当月工资20%，否则违法。
4. 以罚款/绩效不达标等非法定理由扣薪：《劳动法》第五十条明确禁止无故克扣，故此类扣薪违法。
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工资被扣可能面临法律风险，具体如下：

1. 诉讼时效风险：劳动仲裁时效为一年。例如，2023年1月发现2022年12月工资被克扣，2024年2月才申请仲裁，则超过时效（除非有不可抗力或正当理由），仲裁可能驳回申请。
2. 证据链风险：缺乏证据可能无法维权。比如，员工主张被克扣工资，但无劳动合同、工资条或银行流水证明扣薪事实，而用人单位否认，可能因证据不足败诉。
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工资被扣的特殊处理情形如下：

1. 扣薪合法情形：若用人单位扣薪基于《工资支付暂行规定》第十五条的法定代扣情形，或员工造成经济损失且符合扣薪比例、最低工资标准要求，则扣薪合法，员工无法要求返还。例如，依法代扣个税后的工资发放是合法的。
2. 员工同意的扣薪：若员工与单位协商一致（如自愿捐款、赔偿小额损失等），且有书面协议或签字确认，此类扣薪合法有效，员工不得反悔。
3. 基于合法规章制度扣薪：若用人单位规章制度经民主程序制定并公示，且明确扣薪情形和标准，员工违反后扣薪（比例、金额合法），则扣薪合法。例如，规章制度规定迟到早退扣薪且已公示，扣薪即合法。
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判断工资被扣是否合法，可依据《劳动法》和《工资支付暂行规定》分析：

《劳动法》第五十条规定“工资应按月支付，不得克扣或无故拖欠”。《工资支付暂行规定》第十五条明确用人单位可代扣的情形：个税、社保、法院判决代扣的抚养费/赡养费，及其他法定扣除项。若扣薪理由不在上述范围内，也无合法经济损失扣薪情形，则用人单位违反《劳动法》第五十条，构成无故克扣工资，员工有权要求补发。

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